Учёный совет является высшим выборным представительным органом, осуществляющим общее руководство ЖАГУ. Целью работы Ученого совета является определение текущих и перспективных направлений деятельности университета, объединение усилий руководства университета, научно-педагогических работников, учебно-вспомогательного персонала по подготовке специалистов, координация учебной, учебно-методической, научно-исследовательской и воспитательной деятельности университета.

Состав и порядок формирования Учёного совета, его полномочия, руководство Учёным советом, права и обязанности его членов, организация работы совета и порядок проведения заседаний определены «Положением об Учёном совете ЖАГУ», «Регламентом Учёного совете ЖАГУ»

Основные задачи Учёного совета

1. Определение структуры университета, внесение изменений;

2. Принятие решений об открытии новых направлений подготовки специалистов по основным и дополнительным программам профессионального образования;

3. Утверждение образовательных программ и учебных планов;

4. Утверждение основных положений, регламентирующих учебную, научную и воспитательную работу в университете;

5. Определение процедуры и организация выборов ректора, деканов и заведующих кафедрами;

6. Рассмотрение вопросов о присвоении учёных званий и замещение должностей научно-педагогических работников;

7. Утверждение годовых смет, доходов и расходов университета, заслушивание отчётов об их исполнении;

8. Определение стратегии развития предпринимательской деятельности, распределение внебюджетных и иных средств на производственные и социальные нужды университета;

9. Решение вопросов международного и межвузовского сотрудничества;

10. Присвоение почётных званий ЖАГУ.